stk

强大的Python分子构建与操作库

stk Python库分子构建分子设计数据库 Github 开源项目

stk是一个功能丰富的Python库，用于构建和操作复杂分子结构。它支持自动分子设计、分子数据库创建和属性分析。stk提供灵活API，适用于多种化学和材料科学研究。该库已应用于有机笼、共价有机骨架和共轭聚合物等领域的设计与优化研究。

文档

REINVENT4 - 人工智能驱动的多功能分子设计工具

GithubREINVENT分子设计化学信息学开源项目强化学习迁移学习

REINVENT 4是一款基于强化学习的先进分子设计工具，支持从头设计、骨架跳跃和R基团替换等多种任务。它根据多组分评分标准生成优化分子，并通过迁移学习提高设计效率。该工具兼容Linux、Windows和MacOS平台，支持GPU和CPU运行，为药物研发和化学创新提供了有力支持。

OpenMDAO - 开源Python系统分析与多学科优化计算平台

GithubOpenMDAOPython多学科优化开源项目系统分析高性能计算

OpenMDAO是一个用Python开发的开源高性能计算平台，专门用于系统分析和多学科优化。它支持模型分解，便于构建和维护，同时通过高效并行算法实现紧密耦合求解。平台主要支持基于梯度的优化和解析导数，可处理大规模设计空间。此外，OpenMDAO还提供并行计算功能，适用于无梯度优化、混合整数非线性规划和设计空间探索。

vsketch - Python绘图仪生成艺术工具包

GithubPythonvsketch开源项目生成艺术绘图工具绘图机

vsketch是一款面向绘图仪用户的Python生成式艺术工具包。它提供类Processing的API，注重易用性和自动化创作流程。vsketch包含CLI工具vsk和简洁API，支持项目管理、交互式渲染和批量导出。兼容Numpy和Shapely等库，为绘图仪艺术创作提供有力支持。无论是初学者还是经验丰富的艺术家，都能利用vsketch快速创作和迭代独特的绘图仪作品。

networkx - 全面的复杂网络分析与操作Python库

GithubNetworkXPython库图论复杂网络开源项目网络分析

NetworkX是一个功能强大的Python库，专门用于复杂网络的创建、分析和可视化。它支持多种网络类型，包括社交、生物和交通网络等。该库提供了丰富的图算法，如最短路径计算、中心性分析和社区检测，并具有excellent的可扩展性。NetworkX广泛应用于学术研究和工业领域，支持高效的大规模网络处理和数据挖掘。

dstack - 轻量级AI模型管理工具，兼容Kubernetes与主流云服务

AI模型管理GithubGoogle Cloud TPUNVIDIA GPUdstack云提供商开源项目

dstack是一款轻量级工具，专为AI模型的开发、训练和部署而设计，可以作为Kubernetes的替代品。支持NVIDIA GPU和Google Cloud TPU，并兼容多种云服务提供商（如AWS、GCP、Azure等）和本地集群。dstack使用简单，无论是在云端还是本地，都能轻松配置和管理集群。其最新版本不断更新，提供高效便捷的体验。

matminer - 材料科学数据挖掘的开源利器

GithubPython库matminer开源工具开源项目数据挖掘材料科学

matminer是一个面向材料科学领域的开源数据挖掘库。该项目支持Python 3.9+，提供数据集和特征提取工具，便于研究人员进行材料数据分析。matminer包含详细文档、示例仓库和支持论坛，涵盖数据检索、特征化和数据集管理功能。此外，项目还提供了相关工具如automatminer和matbench，进一步扩展了其在材料科学研究中的应用范围。作为开源项目，matminer鼓励用户在研究中引用相关论文，并提供了方便的citation()方法来获取引用信息，体现了其学术价值和在材料科学社区中的影响力。

Reinvent - 分子设计与优化的开源人工智能工具

GPUGithubPythonREINVENT分子设计开源项目机器学习

REINVENT 3.2是一个开源的分子设计与优化工具，结合深度学习和强化学习技术实现分子生成和优化。该基于Python的项目支持多种运行模式，使用JSON配置文件控制，并利用CUDA加速的GPU进行计算。REINVENT 3.2提供详细的安装指南、系统要求和使用教程，支持Jupyter notebook交互式使用，便于研究人员快速上手和实验。此外，项目还包含单元测试框架，可广泛应用于药物研发和材料设计等领域的分子设计任务。

ChemBERTa-zinc-base-v1 - 面向分子结构预测与化学特性分析的深度学习模型

ChemBERTaGithubHuggingfaceRoBERTaSMILES化学机器学习开源项目模型深度学习

ChemBERTa-zinc-base-v1是一个专注于化学分子结构分析的深度学习模型。通过对大规模分子数据的训练，该模型能够进行分子结构预测，并支持毒性、溶解度、药物相似性等化学特性分析。模型创新地将自然语言处理技术应用于化学领域，为研究人员提供了一个高效的分子结构分析工具。

lbry-sdk - 构建去中心化数字内容网络的开发工具包

GithubLBRY区块链去中心化开源项目数字内容点对点协议

LBRY SDK是一个开源的Python开发工具包,专为构建去中心化数字内容应用而设计。它基于LBRY区块链,实现了分布式内容存储和访问。核心功能包括分布式哈希表、数据交换协议、元数据处理、区块链钱包和API接口,为开发者提供了全面的去中心化应用构建支持。

Mol-Instructions - 大规模生物分子指令数据集助力大语言模型

GithubMol-Instructions大语言模型开源项目数据集生物分子蛋白质

Mol-Instructions是一个开放的大规模生物分子指令数据集,包含分子导向、蛋白质导向和生物分子文本三类指令。数据集涵盖分子设计、蛋白质功能预测等多个任务,通过AI协作、数据提取和模板转换等方法构建。该数据集旨在增强大语言模型在生物分子领域的表现,现已在Hugging Face平台发布。

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