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stk

强大的Python分子构建与操作库

stk是一个功能丰富的Python库,用于构建和操作复杂分子结构。它支持自动分子设计、分子数据库创建和属性分析。stk提供灵活API,适用于多种化学和材料科学研究。该库已应用于有机笼、共价有机骨架和共轭聚合物等领域的设计与优化研究。

datamol - 基于RDKit的高效分子处理Python库
GithubPython库RDKitdatamol分子处理化学信息学开源项目
datamol是一个基于RDKit的Python库,专为简化分子处理而设计。它提供简洁的API、高效的并行处理和现代IO支持,同时保持与RDKit的兼容性。通过良好的默认设置,datamol简化了分子标准化、构象生成和特征计算等任务,使分子操作更加便捷高效。该库支持远程路径读写多种格式文件,适用于大规模数据处理。datamol的设计理念是在RDKit基础上提供更简单的接口,同时保持性能和灵活性,使其成为分子信息学研究和开发的有力工具。
stability-sdk - 与Stability API交互的高效客户端与命令行工具
APIColabGithubPython客户端stability-sdk图像生成开源项目
stability-sdk提供与Stability API交互的便捷解决方案,包括Python客户端和命令行工具,用户可以通过简单的pip命令安装,并使用多种命令行选项生成和放大图像。支持多种风格和采样器选择,文档详实,欢迎访问项目平台查看更多信息及社区贡献的客户端实现。
deepmd-kit - 深度学习驱动的原子势能建模与分子动力学模拟工具
DeePMD-kitGithub分子动力学势能模型开源项目深度学习高性能计算
DeePMD-kit是一个用Python和C++编写的软件包,专注于简化深度学习原子势能模型和力场的创建和分子动力学模拟。它与TensorFlow及多个高性能MD和量子MD软件包接口,确保高效的训练和计算。模块化设计使其支持多种描述符和高性能并行计算,适用于有机分子、金属、半导体等系统。
ChatMol - 使用自然语言驱动的PyMOL交互式分子可视化分析工具
ChatMolGithubPyMOL分子可视化开源项目插件自然语言交互
ChatMol是一款PyMOL插件,通过自然语言交互实现分子可视化和分析。它支持命令行、迷你GUI、Python和网页浏览器等多种交互方式,集成了大型语言模型。ChatMol可执行PyMOL任务,提供建议和解释。该工具还包括Streamlit应用、Python包和在线问答系统。ChatMol简化了分子结构分析过程,无需复杂设置即可使用。
stark - 大规模半结构化检索基准,推动LLM性能提升
GithubSTaRK大规模开源项目查询数据集检索系统知识基
STaRK提供一个大规模的半结构化检索基准,涵盖产品搜索、学术论文检索和生物医学查询,旨在评估和提升LLM在文本与关系型知识库中的检索效果。该基准含有多样化和现实的查询,要求上下文相关推理,为未来研究提供有力支持。STaRK已在Hugging Face平台发布,并可以通过pip包直接加载,支持用户互动查询的探索性界面。更多详情请访问官方网站。
stanza - Python自然语言处理库,支持多种语言
GithubNLPPythonStanford CoreNLPStanza开源项目生物医学
Stanza是斯坦福NLP团队开发的Python自然语言处理库,支持60多种语言,提供高精度的自然语言处理工具,并可与Java Stanford CoreNLP软件集成。新推出的生物医学和临床英文模型包可以处理生物医学文献和临床笔记的句法分析和命名实体识别。Stanza可通过pip和Anaconda安装,适用于Python 3.6及以上版本,提供详细的文档和在线示例,帮助用户快速入门并高效使用。
molfeat - 多功能分子特征提取框架
Githubmolfeat分子特征提取化学信息学开源软件开源项目机器学习
molfeat是一个开源的分子特征提取框架,集成多种预置分子特征提取器。它提供简洁高效的API,统一预训练分子嵌入和传统特征提取方法。框架支持通过插件扩展自定义特征提取器,并采用缓存机制优化性能。作为分子特征化的综合解决方案,molfeat适用于广泛的分子建模和分析应用场景。
deepchem - 深度学习在药物发现、材料科学中的开源工具链
DeepChemGithub开源项目材料科学深度学习药物发现量子化学
DeepChem是一个高质量的开源工具链,致力于推动深度学习在药物发现、材料科学、量子化学和生物学中的应用。支持Python 3.7至3.10,兼容TensorFlow、PyTorch、JAX等框架。用户可通过pip或conda安装,或使用Docker镜像。项目包含丰富的教程和实例,适合从新手到专家。社区活跃,提供Discord和讨论论坛,欢迎科学家、开发者和爱好者的参与。
sktime - 多功能时间序列分析和预测库
GithubPython库sktime开源项目时间序列分析机器学习统一接口
sktime是一个开源的Python时间序列分析库,为多种时间序列学习任务提供统一接口。它支持时间序列分类、回归、聚类、标注和预测等功能,并提供专门的时间序列算法和兼容scikit-learn的工具。sktime还整合了多个相关库的接口,便于用户在不同时间序列任务间迁移算法。
stlink - 多功能STM32开源编程调试工具集 支持多代STLINK
GithubSTLINK ToolsSTM32STMicroelectronics开源项目编程调试工具
stlink是一款开源工具集,专门用于STM32设备的编程和调试。它兼容多代STLINK编程器,提供了st-info、st-flash等多个实用工具和可选的图形界面。支持多种操作系统,可从源码编译安装。该项目为开发者提供了灵活高效的STM32开发解决方案。
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