stk

强大的Python分子构建与操作库

stk Python库分子构建分子设计数据库 Github 开源项目

stk是一个功能丰富的Python库，用于构建和操作复杂分子结构。它支持自动分子设计、分子数据库创建和属性分析。stk提供灵活API，适用于多种化学和材料科学研究。该库已应用于有机笼、共价有机骨架和共轭聚合物等领域的设计与优化研究。

文档

api - Materials Project API 材料科学数据访问工具

APIGithubMaterials ProjectPython开发环境开源项目数据下载

Materials Project API是一个面向材料科学研究的开源工具，提供了访问Materials Project数据库的核心客户端实现。支持Python 3.9+，此API使用户能够高效地查询和下载大规模材料数据。项目提供详细文档，指导开发者如何使用API获取最新的材料数据。该工具旨在为材料科学研究提供数据支持，促进相关领域的创新和发展。

pybind11-stubgen - 自动生成Python扩展模块类型存根文件的开源工具

GithubIDE支持Python扩展pybind11-stubgen存根生成开源项目静态分析

pybind11-stubgen是一个为Python扩展模块生成类型存根文件的开源工具。它可自动创建存根文件，帮助静态分析工具和IDE更好地理解和处理二进制扩展。虽然针对pybind11编译的模块进行了优化，但也适用于其他库构建的模块。通过命令行操作，开发者可以生成存根文件，提高Python项目的开发效率和代码质量。

DnaFeaturesViewer - 功能强大的DNA序列特征可视化Python库

DNA Features ViewerGithubPython库可视化工具基因组开源项目生物信息学

DnaFeaturesViewer是一款功能强大的DNA序列特征可视化Python库。它能自动生成清晰简洁的图表,即使是复杂的重叠特征和长标签序列也能完美展示。该库兼容Matplotlib和Biopython,支持多种图像输出格式。DnaFeaturesViewer可从GenBank或GFF文件读取特征,绘制核苷酸序列和氨基酸翻译,并支持多行多页绘图。它为DNA序列分析和生物学研究提供了直观高效的可视化工具。

Stellr - 智能化电子实验记录系统助力现代科研

AI工具ELN实验室笔记本数据集中化研究管理科学家工具

Stellr是一款先进的电子实验记录本软件(electronic lab notebook software)和研究数据管理系统(research data management system)，为现代科研工作提供全面支持。这款智能化电子实验记录本(ELN)软件革新了传统纸质记录方式，提供了集中管理实验数据的数字化平台。Stellr支持快速记录、高效搜索和便捷共享实验数据，有助于提升研究效率。该系统不仅优化了实验记录流程，还增强了团队协作能力，适用于生物制药等领域的研究数据管理。

miditoolkit - Python开源MIDI处理工具包

GithubMIDI文件处理MiditoolkitPython包开源项目符号音乐音乐编程

Miditoolkit是一个开源的Python MIDI处理库，采用ticks作为原生时间单位。它提供MIDI文件的读取、编辑和写入功能，支持钢琴卷帘解析、全局MIDI属性管理、乐器控制和可视化。与其他工具相比，Miditoolkit在纯MIDI和符号音乐处理方面性能更优。它适用于音乐创作、MIDI文件分析和音乐信息检索等领域，为开发者提供了高效、灵活的MIDI处理解决方案。

dpdata - Python工具包实现计算科学软件数据格式的灵活处理

DeePMD-kitGithubPython包dpdata开源项目数据格式计算科学

dpdata是一个面向计算科学软件的Python工具包，支持多种数据格式如DeePMD-kit、VASP和LAMMPS等。该工具包提供数据加载、操作和导出功能，可处理单帧和多帧系统数据，支持标记和非标记系统。dpdata具备丰富的数据访问和转换方法，同时支持原子系统的复制、扰动和替换，以及化学键和形式电荷的处理。

REINVENT4 - 人工智能驱动的多功能分子设计工具

GithubREINVENT分子设计化学信息学开源项目强化学习迁移学习

REINVENT 4是一款基于强化学习的先进分子设计工具，支持从头设计、骨架跳跃和R基团替换等多种任务。它根据多组分评分标准生成优化分子，并通过迁移学习提高设计效率。该工具兼容Linux、Windows和MacOS平台，支持GPU和CPU运行，为药物研发和化学创新提供了有力支持。

OpenMDAO - 开源Python系统分析与多学科优化计算平台

GithubOpenMDAOPython多学科优化开源项目系统分析高性能计算

OpenMDAO是一个用Python开发的开源高性能计算平台，专门用于系统分析和多学科优化。它支持模型分解，便于构建和维护，同时通过高效并行算法实现紧密耦合求解。平台主要支持基于梯度的优化和解析导数，可处理大规模设计空间。此外，OpenMDAO还提供并行计算功能，适用于无梯度优化、混合整数非线性规划和设计空间探索。

vsketch - Python绘图仪生成艺术工具包

GithubPythonvsketch开源项目生成艺术绘图工具绘图机

vsketch是一款面向绘图仪用户的Python生成式艺术工具包。它提供类Processing的API，注重易用性和自动化创作流程。vsketch包含CLI工具vsk和简洁API，支持项目管理、交互式渲染和批量导出。兼容Numpy和Shapely等库，为绘图仪艺术创作提供有力支持。无论是初学者还是经验丰富的艺术家，都能利用vsketch快速创作和迭代独特的绘图仪作品。

networkx - 全面的复杂网络分析与操作Python库

GithubNetworkXPython库图论复杂网络开源项目网络分析

NetworkX是一个功能强大的Python库，专门用于复杂网络的创建、分析和可视化。它支持多种网络类型，包括社交、生物和交通网络等。该库提供了丰富的图算法，如最短路径计算、中心性分析和社区检测，并具有excellent的可扩展性。NetworkX广泛应用于学术研究和工业领域，支持高效的大规模网络处理和数据挖掘。

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