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BioGPT

预训练Transformer模型为生物医学文本提供强大工具

BioGPT是一个针对生物医学文本的预训练Transformer模型。该模型在关系提取、文档分类和问答等下游任务中表现优异。项目提供预训练模型和特定任务的微调模型,可通过多种渠道获取。BioGPT支持文本生成、特征提取等多种应用场景,为生物医学自然语言处理研究提供了实用工具。

biomedical-ner-all - 基于英语的生物医学实体识别AI模型
AIGithubHuggingfaceMaccrobatNamed Entity Recognitiontransformers库开源项目模型生物医学
该AI模型基于Maccrobat数据集训练,可以识别107种生物医学实体,适用于案例报告等文本工作。通过distilbert-base-uncased构建,拥有低碳排放(0.0279千克)和30.17分钟的训练时间。通过Huggingface API或transformers库,可便捷应用于生物医学领域;教程视频提供详细使用说明。
ZeroShotBioNER - 高效生物医学命名实体识别的突破性方法
BERTGithubHuggingface命名实体识别少样本学习开源项目模型生物医学文本识别零样本学习
ZeroShotBioNER是一种创新的生物医学命名实体识别模型,基于Transformer架构,支持零样本和少样本学习。该模型在25多个生物医学NER类别上训练,可识别疾病、化学物质、基因等多种实体。其突出优势在于能进行零样本推理,并仅需少量样本即可针对新类别进行微调。模型采用BioBERT架构,提供详细的使用说明和丰富的实体类别列表,为生物医学文本分析提供了强大工具。
gpt-2 - GPT-2模型展现自然语言处理新境界
GPT-2GithubOpenAI开源项目机器学习自然语言处理语言模型
GPT-2是OpenAI开发的自然语言处理模型,展现了无监督学习在多任务处理中的卓越能力。项目开源了模型代码和预训练模型,便于研究人员探索其潜力。尽管性能出色,使用时仍需审慎评估其适用性,尤其是在安全关键领域。该项目也鼓励深入研究GPT-2的行为特征及其潜在影响。
DNABERT - DNABERT:用于基因组DNA语言处理的双向编码器模型
BERTDNABERTGPUGithub基因组开源项目预训练模型
DNABERT提供完整的源码、使用示例、预训练和微调模型,适用于各类基因组DNA语言处理任务。该项目利用Huggingface的扩展工具,增添了多任务支持和高效的可视化功能。最新版DNABERT-2不仅提升了多物种基因组的处理能力,还发布了全面的Genome Understanding Evaluation (GUE)基准测试,涵盖28个数据集。
Bio_Discharge_Summary_BERT - 改进电子健康记录分析的Bio_Discharge_Summary_BERT模型
ClinicalBERTGithubHuggingfaceMIMIC III开源项目机器学习模型电子健康记录自然语言处理
Bio_Discharge_Summary_BERT模型基于BioBERT进行初始化,专注于分析MIMIC III数据库的出院小结文本。经过专业的数据预处理和基于Google BERT的训练,该模型在医疗文本处理任务中展现出优异表现,可以通过transformers库加载,用于医疗研究和实际应用。
BioLORD-2023-M - 生物医学句子相似度模型,覆盖多种语言
BioLORDGithubHuggingface临床对比学习开源项目本体论模型语义表示
该项目利用BioLORD预训练策略,提升临床句子与生物医学概念的语义表示。通过多关系知识图谱中的定义和描述,实现概念表示的语义化与层次匹配。模型在临床句子和生物医学概念的相似度上表现卓越,支持七种欧洲语言。
SapBERT-from-PubMedBERT-fulltext-mean-token - 生物医学实体表示自对齐预训练模型
GithubHuggingfaceSapBERT实体表示开源项目模型生物医学自然语言处理语义关系
SapBERT是基于PubMedBERT开发的生物医学预训练模型,采用自对齐技术优化实体语义表示。该模型在医学实体链接任务中表现卓越,创下多项基准测试新纪录。它能有效捕捉精细语义关系,为实体链接等任务提供强大支持。研究人员可通过简单的代码实现实体嵌入提取,便于进行生物医学文本分析。
AnyGPT - 基于离散序列建模的多模态语言模型
AnyGPTGithub多模态语言模型大语言模型开源项目模态转换离散序列建模
AnyGPT是一款基于离散序列建模的多模态语言模型,能够统一处理语音、文本、图像和音乐等多种模态。该模型通过将不同模态数据转换为统一的离散表示,实现了模态间的转换和自由对话。AnyGPT包含基础模型和聊天模型两个版本,前者实现了四种模态的对齐,后者基于AnyInstruct数据集训练,支持灵活的多模态交互。
datasetGPT - 基于大型语言模型的文本数据集生成工具
API接口GithubdatasetGPT命令行工具大语言模型开源项目数据集生成
datasetGPT是一个命令行工具和Python库,用于通过大型语言模型生成文本数据集。支持OpenAI、Cohere和Petals等多个LLM后端,可生成文本和对话数据。适用于构建AI检测器训练语料库、收集LLM生成的对话数据集进行研究,以及批量处理文本等场景。通过灵活的参数配置,datasetGPT能够生成多样化的数据集。
image-gpt - 支持多数据集的生成预训练模型
CIFAR10Fashion-MNISTGithubImage GPTPyTorch开源项目生成式预训练
Image GPT是一个基于生成像素预训练模型(Generative Pretraining from Pixels)的PyTorch实现,支持多种预训练模型和数据集。该项目允许下载预训练模型、量化图像、进行生成预训练和分类微调。它还具有BERT风格的预训练、支持加载OpenAI预训练模型等功能。目前,使用单个NVIDIA 2070 GPU可在Fashion-MNIST上实现高效训练,简化了多种图像数据集上的生成模型训练和应用流程。
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