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生成式AI和深度学习在分子设计与优化中的应用

Generative AI Deep Learning molecular设计分子构象生成药物设计 Github 开源项目

此页面汇总了生成式AI和深度学习在分子设计和分子构象生成中的研究及资料。涵盖分子优化、数据集和基准、药物相似性和评估指标，以及基于结构、片段等生成模型的评论。这些资源对药物设计、材料发现和生命科学研究人员非常有用，并提供最新的学术和应用进展，持续更新。

awesome-AI-based-protein-design - AI蛋白质设计研究前沿资源汇总

Github人工智能开源项目深度学习生成模型结构预测蛋白质设计

本资源库汇集了AI驱动蛋白质设计领域的前沿研究成果,包括来自Nature、Science等顶级期刊的重要论文。内容涵盖概述、方法论和应用等多个方面,按类别进行组织。资源库持续更新,跟踪该领域最新进展,为研究人员提供参考。探索AI在蛋白质设计中的创新应用,关注这一不断发展的交叉学科领域。

REINVENT4 - 人工智能驱动的多功能分子设计工具

GithubREINVENT分子设计化学信息学开源项目强化学习迁移学习

REINVENT 4是一款基于强化学习的先进分子设计工具，支持从头设计、骨架跳跃和R基团替换等多种任务。它根据多组分评分标准生成优化分子，并通过迁移学习提高设计效率。该工具兼容Linux、Windows和MacOS平台，支持GPU和CPU运行，为药物研发和化学创新提供了有力支持。

AI2BMD - AI驱动的高精度蛋白质分子动力学模拟工具

AI2BMDGithub分子动力学模拟开源项目机器学习蛋白质计算化学

AI2BMD是一个结合人工智能和从头计算方法的蛋白质分子动力学模拟工具。它包含AIMD-Chig数据集、ViSNet和Geoformer模型架构，以及完整的模拟程序。该工具在保持高精度的同时提高了模拟效率，为蛋白质研究和药物开发提供了新的研究方法。

Reinvent - 分子设计与优化的开源人工智能工具

GPUGithubPythonREINVENT分子设计开源项目机器学习

REINVENT 3.2是一个开源的分子设计与优化工具，结合深度学习和强化学习技术实现分子生成和优化。该基于Python的项目支持多种运行模式，使用JSON配置文件控制，并利用CUDA加速的GPU进行计算。REINVENT 3.2提供详细的安装指南、系统要求和使用教程，支持Jupyter notebook交互式使用，便于研究人员快速上手和实验。此外，项目还包含单元测试框架，可广泛应用于药物研发和材料设计等领域的分子设计任务。

awesome-generative-ai-guide - 全面的生成式AI研究与开发资源库

Githubawesome-generative-ai-guide人工智能大语言模型开源项目机器学习生成式AI

best_AI_papers_2023 - 2023年人工智能领域重大突破性研究概览

AIGithubdiffusion模型开源项目深度学习生成模型计算机视觉

本项目整理了2023年人工智能领域的重大突破性研究,涵盖生成式AI、机器人技术等热点方向。汇总了语音合成、图像编辑、音乐生成、视频处理、多模态语言模型等前沿技术的代表性论文,并提供视频讲解、深度分析文章和代码实现(如有)。这份精选资料展示了AI技术的最新进展,为业内人士提供了宝贵的学习参考。

Mol-Instructions - 大规模生物分子指令数据集助力大语言模型

GithubMol-Instructions大语言模型开源项目数据集生物分子蛋白质

Mol-Instructions是一个开放的大规模生物分子指令数据集,包含分子导向、蛋白质导向和生物分子文本三类指令。数据集涵盖分子设计、蛋白质功能预测等多个任务,通过AI协作、数据提取和模板转换等方法构建。该数据集旨在增强大语言模型在生物分子领域的表现,现已在Hugging Face平台发布。

deepmd-kit - 深度学习驱动的原子势能建模与分子动力学模拟工具

DeePMD-kitGithub分子动力学势能模型开源项目深度学习高性能计算

DeePMD-kit是一个用Python和C++编写的软件包，专注于简化深度学习原子势能模型和力场的创建和分子动力学模拟。它与TensorFlow及多个高性能MD和量子MD软件包接口，确保高效的训练和计算。模块化设计使其支持多种描述符和高性能并行计算，适用于有机分子、金属、半导体等系统。

genie - 创新算法实现蛋白质从头设计开源项目助力生物技术突破

GenieGithub开源项目氨基酸残基深度学习等变扩散蛋白质设计

Genie是一个开源的人工智能蛋白质设计项目，利用机器学习算法自动生成新型蛋白质结构。它提供完整的代码库，支持模型训练、结构采样和性能评估。研究人员可使用Genie设计长度为50至128个氨基酸的蛋白质，应用于生物技术、医药研发和材料科学等领域。项目集成了多种评估工具，为蛋白质工程提供了创新解决方案，为研究人员带来新的可能性。

must-read-papers-for-ml - 精选机器学习和数据科学必读论文资源集

Github开源项目数据科学机器学习深度学习神经网络论文集

本项目汇集了数据科学、机器学习和深度学习领域的重要论文和综述文章。涵盖数据预处理、深度学习技术、推荐系统和计算机视觉等多个主题。资源按重要性分类,并提供链接,方便读者学习和追踪最新进展。项目持续更新,欢迎贡献新的学术资源。

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