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基于Transformer的神经网络架构实现精准基因表达预测

长程相互作用深度学习Enformer基因表达预测HuggingfaceGithub开源项目模型Transformer架构

Enformer是一个基于Transformer的神经网络架构，能从DNA序列中精确预测基因表达。该模型由Avsec等人在Nature期刊发表，并在DeepMind的GitHub仓库首次公开。本项目将官方权重移植至PyTorch，为基因组学研究提供了有力工具。研究人员可参考enformer-pytorch的使用说明，进行基因表达预测和分析。该模型在整合长程相互作用方面表现出色，大幅提高了基因表达预测的准确性。

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repeat - 开源自然语言处理库
GithubHuggingfacetransformers人工智能开源项目机器学习模型深度学习自然语言处理
Transformers是一个开源的自然语言处理库，提供了多种预训练模型和工具。该库支持文本分类、命名实体识别和机器翻译等任务，具有良好的文档支持和定期更新特性。研究人员和开发者可以使用Transformers构建和部署NLP应用。
InfiniTransformer - 非官方的PyTorch和Transformers实现
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InfiniTransformer是一个非官方的PyTorch和Transformers实现，支持Llama3和Gemma模型。包含两种Infini注意力实现类型：全模型替换和仅替换注意力层。详细介绍了从克隆仓库、安装依赖到训练和推理的步骤，便于用户快速上手和扩展。
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GithubIMDb数据集PyTorchtransformer分类实验开源项目自注意力机制
详细介绍了如何使用PyTorch从零开始实现简单的Transformer模型，包含安装和使用指南，以及通过命令行控制超参数和数据自动下载的说明。
iTransformer - 先进的时间序列预测模型，打造SOTA性能
GithubiTransformer人工智能开源项目时间序列预测注意力网络深度学习
iTransformer是一种基于注意力机制的时间序列预测模型，由清华大学和蚂蚁集团研究人员开发。该模型采用倒置Transformer结构，支持多变量和多步长预测。iTransformer引入了可逆实例归一化等技术，旨在提高预测准确性和处理长序列数据的能力。这个开源项目为时间序列分析提供了新的研究方向。项目提供Python实现，支持使用PyTorch框架。用户可通过pip安装并轻松集成到现有的时间序列分析工作流程中。该项目还包括实验性功能，如二维注意力和傅里叶变换增强版本，为研究人员提供了探索和改进的空间。
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