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Reinvent

分子设计与优化的开源人工智能工具

REINVENT机器学习分子设计PythonGPUGithub开源项目

REINVENT 3.2是一个开源的分子设计与优化工具，结合深度学习和强化学习技术实现分子生成和优化。该基于Python的项目支持多种运行模式，使用JSON配置文件控制，并利用CUDA加速的GPU进行计算。REINVENT 3.2提供详细的安装指南、系统要求和使用教程，支持Jupyter notebook交互式使用，便于研究人员快速上手和实验。此外，项目还包含单元测试框架，可广泛应用于药物研发和材料设计等领域的分子设计任务。

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介绍相关项目
Graphormer - 优化分子科学中的AI研究和应用
Azure Quantum ElementsGithubGraphormer分子建模开源项目材料科学药物发现
Graphormer是一个深度学习包，用于加速分子科学中的AI研究和应用，如材料发现和药物发现。它支持PyG、DGL、OGB和OCP的数据接口，并采用fairseq框架。提供PCQM4M和PCQM4Mv2的预训练模型，特别适合大规模分子建模任务。优化的预训练版本可在Azure Quantum Elements上使用。
rxnmapper - 利用无监督学习的有机化学反应原子映射工具
GithubRXNMapper化学反应原子映射开源项目有机化学机器学习
rxnmapper是一个开源的有机化学反应原子映射工具，利用机器学习技术，通过ALBERT模型在大规模化学反应数据集上进行无监督学习，提取有机化学语法，实现对有效反应SMILES的原子映射。项目提供Python API接口，支持批处理和错误处理，可集成到化学信息学应用中。rxnmapper为化学反应分析和预测提供了新的方法，有助于推进有机化学研究。
AlphaFold3 - 预测蛋白质相互作用结构的开源工具
AlphaFold3GithubPyTorch开源项目深度学习蛋白质结构预测遗传扩散
AlphaFold3通过基因扩散模型实现了生物分子相互作用结构的精确预测。该模型处理包括聚合物序列、残基修饰和配体smiles符号等多种输入数据，适用于预测多达1000个残基的蛋白质结构。独特的交叉蒸馏方法和信心评估机制减少了模型幻觉问题，增强了预测的可信度。用户可通过PyTorch和Docker容器便捷安装和运行该模型。
ChemBERTa-zinc-base-v1 - 面向分子结构预测与化学特性分析的深度学习模型
ChemBERTaGithubHuggingfaceRoBERTaSMILES化学机器学习开源项目模型深度学习
ChemBERTa-zinc-base-v1是一个专注于化学分子结构分析的深度学习模型。通过对大规模分子数据的训练，该模型能够进行分子结构预测，并支持毒性、溶解度、药物相似性等化学特性分析。模型创新地将自然语言处理技术应用于化学领域，为研究人员提供了一个高效的分子结构分析工具。
AI-Optimizer - 涵盖从无模型到基于模型，从单智能体到多智能体的多种算法的多功能深度强化学习平台
AI-OptimizerGithub多智能体强化学习开源项目深度强化学习离线强化学习自监督学习
AI-Optimizer是一款多功能深度强化学习平台，涵盖从无模型到基于模型，从单智能体到多智能体的多种算法。其分布式训练框架高效便捷，支持多智能体强化学习、离线强化学习、迁移和多任务强化学习、自监督表示学习等，解决维度诅咒、非平稳性和探索-利用平衡等难题，广泛应用于无人机、围棋、扑克、机器人控制和自动驾驶等领域。
openvino - 提升深度学习模型部署与优化的开源工具包
AI应用GithubOpenVINO开源项目性能提升模型部署深度学习模型优化热门
OpenVINO™是一款开源软件工具包，用于优化和部署深度学习模型。它支持多种框架如TensorFlow、PyTorch等，能在从边缘到云的多种平台上高效部署。此工具包还包含大量社区资源和教程，助力提升计算机视觉、自然语言处理等领域的模型性能。
DMFF - 革新分子模拟和力场参数化的全可微分子力场
DMFFGithub分子力场参数优化开源项目机器学习自动微分
DMFF是一个基于Jax的Python包，实现全可微分子力场模型。它简化力场参数化，支持点电荷和多极化模型，适用于水、生物大分子和有机聚合物系统。DMFF集成自动微分技术和AI优化，支持GPU加速，为分子系统研究和力场开发提供高效工具。
datamol - 基于RDKit的高效分子处理Python库
GithubPython库RDKitdatamol分子处理化学信息学开源项目
datamol是一个基于RDKit的Python库，专为简化分子处理而设计。它提供简洁的API、高效的并行处理和现代IO支持，同时保持与RDKit的兼容性。通过良好的默认设置，datamol简化了分子标准化、构象生成和特征计算等任务，使分子操作更加便捷高效。该库支持远程路径读写多种格式文件，适用于大规模数据处理。datamol的设计理念是在RDKit基础上提供更简单的接口，同时保持性能和灵活性，使其成为分子信息学研究和开发的有力工具。
refinery - 自然语言数据管理和标注的开源解决方案
GithubKern AIrefinery人工智能开源开源项目自然语言处理
开源工具refinery帮助数据科学家管理和提升自然语言处理项目的数据质量。通过半自动化标注和数据监控，提高数据标注效率。支持Hugging Face和spaCy集成，提升处理速度与质量。旨在优化单人开发者与团队的协作，确保训练数据的可靠管理，并提供多语言文本的新分析视角，使NLP模型构建更加快捷高效。
RD-Agent - 工业研发自动化的智能数据驱动平台
GithubR&DRDAgent开源项目数据驱动模型开发自动化
RDAgent专注于自动化工业研发的关键环节，尤其在数据驱动的场景下，优化模型和数据的开发。通过‘R’（科研）和‘D’（开发）两个核心组件，实现研发流程的自动化升级，带来显著的工业应用价值。RDAgent提供多种自动化功能，如量化交易、数据挖掘和研究助手等，显著提升研发效率。用户可通过Docker和Conda快速安装和运行RDAgent，并体验多种在线演示。
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