DMFF

革新分子模拟和力场参数化的全可微分子力场

DMFF 分子力场参数优化自动微分机器学习 Github 开源项目

DMFF是一个基于Jax的Python包，实现全可微分子力场模型。它简化力场参数化，支持点电荷和多极化模型，适用于水、生物大分子和有机聚合物系统。DMFF集成自动微分技术和AI优化，支持GPU加速，为分子系统研究和力场开发提供高效工具。

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介绍相关项目

ASE_ANI - 神经网络势能模型为原子模拟提供高效准确预测

ANIGithub分子动力学开源项目机器学习神经网络势能量子化学

ASE-ANI是一个开源的神经网络势能模型接口，为原子模拟环境(ASE)设计。它集成了ANI-1x和ANI-1ccx模型，可对CHNO元素进行高精度预测。该项目运用深度学习技术，实现了DFT级别的精度和显著降低的计算成本。ASE-ANI支持CUDA加速，适用于配备NVIDIA GPU的Ubuntu系统，为分子动力学模拟等应用提供高效解决方案。

dify - 开源LLM应用开发平台，集成AI工作流和模型管理

DifyGithub人工智能应用企业解决方案开源项目模型支持热门自托管

Dify是一款革命性的开源LLM应用开发平台，提供直观的用户界面和强大的AI工作流功能。该平台支持数百种专有和开源LLM，包括GPT、Mistral、Llama3等，同时提供文档摄取、性能监控、工作流构建等全面功能，满足从原型到生产的所有需求。Dify还支持企业级特性，如单点登录和访问控制，提供自托管解决方案，确保快速部署和高效整合。

MoLFormer-XL-both-10pct - 大规模分子语言模型实现化学结构与性质预测

GithubHuggingfaceMoLFormerSMILES分子结构化学模型开源项目机器学习模型

MoLFormer是一个在ZINC和PubChem数据集上训练的化学语言模型，通过处理11亿分子的SMILES表示实现分子特征学习。模型采用线性注意力机制与旋转位置编码，在MoleculeNet的11个基准任务中展现优异性能。该模型可应用于分子相似度分析、特征提取及分子性质预测，适用于200原子以下的小分子研究。

RNA-FM - 高精度RNA结构和功能预测的解释性基础模型

GithubRNA-FMRNA功能预测RNA结构预测RNA语言模型开源项目预训练模型

RNA-FM是一个基于未注释数据训练的RNA基础模型，在RNA结构预测和功能相关任务中表现出色。项目提供预训练模型和代码，支持RNA嵌入生成和二级结构预测。最新更新包含RNA家族聚类和类型分类教程，以及针对mRNA编码序列的mRNA-FM模型。RNA-FM为RNA研究提供了有力工具，有助于提高RNA结构和功能预测的准确性。

AlphaFold3 - 预测蛋白质相互作用结构的开源工具

AlphaFold3GithubPyTorch开源项目深度学习蛋白质结构预测遗传扩散

AlphaFold3通过基因扩散模型实现了生物分子相互作用结构的精确预测。该模型处理包括聚合物序列、残基修饰和配体smiles符号等多种输入数据，适用于预测多达1000个残基的蛋白质结构。独特的交叉蒸馏方法和信心评估机制减少了模型幻觉问题，增强了预测的可信度。用户可通过PyTorch和Docker容器便捷安装和运行该模型。

dfdx - Rust中的深度学习库，提供GPU加速和编译时类型检查

GPU加速GithubRustdfdx开源项目深度学习神经网络

dfdx是一个注重人体工学和安全性的Rust深度学习库，支持GPU加速和最多6维的张量形状。它在编译时进行形状和类型检查，提供多种张量操作，例如矩阵乘法和卷积。该库还包含神经网络构建模块和标准的深度学习优化器，如Sgd和Adam。设计目标是性能最大化和最小化不安全代码。用户可以启用CUDA特性进行GPU加速，非常适合在Rust中进行深度学习开发的用户。

DRLX - 强化学习框架优化扩散模型

DRLXGithubStable Diffusion分布式训练开源项目强化学习扩散模型

DRLX是一个基于强化学习的扩散模型分布式训练库。它与Hugging Face的Diffusers库集成，支持多GPU和多节点训练。DRLX兼容Stable Diffusion等模型，实现DDPO算法训练。该库采用即插即用设计，训练模型可直接用于原始管道。DRLX集成了美学评分奖励模型和PickAPic提示词生成功能，为扩散模型研究提供了全面的工具集。

Darwin - 材料科学、化学和物理领域的LLaMA模型

AI带动科学研究DarwinGithubLLaMA开放源代码开源项目科学文献

Darwin是一个开源项目，致力于在科学文献和数据集上预训练和微调LLaMA模型，特别针对材料科学、化学和物理领域。Darwin整合了结构化和非结构化的科学知识，提升了语言模型在科学研究中的效率。基于7B LLaMA模型，Darwin在实验带隙预测和金属分类任务中表现优异，超过了Fine-tuned GPT3.5和专用机器学习模型。尽管仍在开发中，Darwin在解决科学问题方面已展现出巨大潜力。

DiffSharp - 开源张量库支持可微分编程和机器学习

DiffSharpGithubPyTorch开源项目张量库微分编程机器学习

DiffSharp是一个开源张量库，专为可微分编程而设计。该项目采用F#语言开发，支持嵌套和混合模式微分，提供常用优化器、模型元素和可微概率分布。DiffSharp结合了PyTorch的命名习惯，支持LibTorch CUDA/C++张量和GPU加速，适用于机器学习、概率编程和优化等领域。它兼容Linux、macOS和Windows平台，可在Jupyter和Visual Studio Code中使用交互式笔记本。

Reinvent - 分子设计与优化的开源人工智能工具

GPUGithubPythonREINVENT分子设计开源项目机器学习

REINVENT 3.2是一个开源的分子设计与优化工具，结合深度学习和强化学习技术实现分子生成和优化。该基于Python的项目支持多种运行模式，使用JSON配置文件控制，并利用CUDA加速的GPU进行计算。REINVENT 3.2提供详细的安装指南、系统要求和使用教程，支持Jupyter notebook交互式使用，便于研究人员快速上手和实验。此外，项目还包含单元测试框架，可广泛应用于药物研发和材料设计等领域的分子设计任务。

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