Fugue 是一个统一的分布式计算接口,允许用户在 Spark、Dask 和 Ray 上执行 Python、Pandas 和 SQL 代码,只需进行最小程度的重写。
Fugue 最常用于:
- 并行化或扩展现有的 Python 和 Pandas 代码,通过最小程度的重写将其迁移到 Spark、Dask 或 Ray。
- 使用 FugueSQL 定义端到端工作流,在 Pandas、Spark 和 Dask DataFrames 之上。FugueSQL 是一个增强的 SQL 接口,可以调用 Python 代码。
要了解 Fugue 与其他框架(如 dbt、Arrow、Ibis、PySpark Pandas)的比较,请参阅对比
Fugue API
Fugue API 是一组能够在 Pandas、Spark、Dask 和 Ray 上运行的函数集合。使用 Fugue 最简单的方法是 transform()
函数。这让用户可以通过将单个函数迁移到 Spark、Dask 或 Ray 来实现并行执行。在下面的示例中,map_letter_to_food()
函数接受一个映射并将其应用于一列。到目前为止,这只是 Pandas 和 Python(不包括 Fugue)。
import pandas as pd
from typing import Dict
input_df = pd.DataFrame({"id":[0,1,2], "value": (["A", "B", "C"])})
map_dict = {"A": "Apple", "B": "Banana", "C": "Carrot"}
def map_letter_to_food(df: pd.DataFrame, mapping: Dict[str, str]) -> pd.DataFrame:
df["value"] = df["value"].map(mapping)
return df
现在,通过调用 Fugue 的 transform()
函数,map_letter_to_food()
函数被迁移到 Spark 执行引擎。输出 schema
和 params
被传递给 transform()
调用。schema
是必需的,因为这是分布式框架的要求。下面的 schema="*"
表示所有输入列都在输出中。
from pyspark.sql import SparkSession
from fugue import transform
spark = SparkSession.builder.getOrCreate()
sdf = spark.createDataFrame(input_df)
out = transform(sdf,
map_letter_to_food,
schema="*",
params=dict(mapping=map_dict),
)
# out 是一个 Spark DataFrame
out.show()
+---+------+
| id| value|
+---+------+
| 0| Apple|
| 1|Banana|
| 2|Carrot|
+---+------+
Fugue transform() 的 PySpark 等效代码
from typing import Iterator, Union
from pyspark.sql.types import StructType
from pyspark.sql import DataFrame, SparkSession
spark_session = SparkSession.builder.getOrCreate()
def mapping_wrapper(dfs: Iterator[pd.DataFrame], mapping):
for df in dfs:
yield map_letter_to_food(df, mapping)
def run_map_letter_to_food(input_df: Union[DataFrame, pd.DataFrame], mapping):
# 转换
if isinstance(input_df, pd.DataFrame):
sdf = spark_session.createDataFrame(input_df.copy())
else:
sdf = input_df.copy()
schema = StructType(list(sdf.schema.fields))
return sdf.mapInPandas(lambda dfs: mapping_wrapper(dfs, mapping),
schema=schema)
result = run_map_letter_to_food(input_df, map_dict)
result.show()
这种语法比 PySpark 等效代码更简单、更清晰、更易于维护。同时,为了将原始的基于 Pandas 的函数迁移到 Spark,没有对其进行任何修改。它仍然可以用于 Pandas DataFrames。Fugue transform()
还支持 Dask 和 Ray 作为执行引擎,以及默认的基于 Pandas 的引擎。
Fugue API 有更广泛的函数集合,这些函数也与 Spark、Dask 和 Ray 兼容。例如,我们可以使用 load()
和 save()
来创建与 Spark、Dask 和 Ray 兼容的端到端工作流。有关完整的函数列表,请参阅 顶级 API
import fugue.api as fa
def run(engine=None):
with fa.engine_context(engine):
df = fa.load("/path/to/file.parquet")
out = fa.transform(df, map_letter_to_food, schema="*")
fa.save(out, "/path/to/output_file.parquet")
run() # 在 Pandas 上运行
run(engine="spark") # 在 Spark 上运行
run(engine="dask") # 在 Dask 上运行
上下文中的所有函数都将在指定的后端上运行。这使得在本地执行和分布式执行之间切换变得容易。
FugueSQL
FugueSQL 是一种基于 SQL 的语言,能够在 Pandas、Spark 和 Dask 之上表达端到端的数据工作流。上面的 map_letter_to_food()
函数在下面的 SQL 表达式中使用。这展示了如何将 Python 定义的函数与标准 SQL SELECT
语句一起使用。
from fugue.api import fugue_sql
import json
query = """
SELECT id, value
FROM input_df
TRANSFORM USING map_letter_to_food(mapping={{mapping}}) SCHEMA *
"""
map_dict_str = json.dumps(map_dict)
# 返回 Pandas DataFrame
fugue_sql(query,mapping=map_dict_str)
# 返回 Spark DataFrame
fugue_sql(query, mapping=map_dict_str, engine="spark")
安装
Fugue 可以通过 pip 或 conda 安装。例如:
pip install fugue
为了使用 Fugue SQL,强烈建议安装 sql
额外组件:
pip install fugue[sql]
它还有以下安装额外组件:
- sql:支持 Fugue SQL。没有这个额外组件,非 SQL 部分仍然可以工作。在 Fugue 0.9.0 之前,这个额外组件包含在 Fugue 的核心依赖中,所以你不需要显式安装。但对于 0.9.0+,如果你想使用 Fugue SQL,这就变成必需的了。
- spark:支持 Spark 作为 ExecutionEngine。
- dask:支持 Dask 作为 ExecutionEngine。
- ray:支持 Ray 作为 ExecutionEngine。
- duckdb:支持 DuckDB 作为 ExecutionEngine,阅读详情。
- polars:支持 Polars DataFrames 和使用 Polars 的扩展。
- ibis:为 Fugue 工作流启用 Ibis,阅读详情。
- cpp_sql_parser:为 Fugue SQL 启用 CPP antlr 解析器。它可以比纯 Python 解析器快 50 多倍。对于主要的 Python 版本和平台,已经有预构建的二进制文件,但对于其余的,它需要一个 C++ 编译器来即时构建。
例如,一个常见的用例是:
pip install "fugue[duckdb,spark]"
注意,如果你已经独立安装了 Spark 或 DuckDB,Fugue 能够自动使用它们,而不需要安装额外组件。
入门
开始使用 Fugue 的最佳方式是完成 10 分钟教程:
对于顶级 API,请参阅:
教程也可以通过 binder 或 Docker 在交互式笔记本环境中运行:
使用 binder
注意在 binder 上运行速度较慢,因为 binder 上的机器对于分布式框架(如 Spark)来说不够强大。并行执行可能变成顺序执行,所以一些性能比较的例子可能无法给你正确的数据。
使用 Docker
另外,你可以通过在自己的机器上运行这个 Docker 镜像来获得不错的性能:
docker run -p 8888:8888 fugueproject/tutorials:latest
Jupyter Notebook 扩展
有一个配套的 notebook 扩展用于 FugueSQL,让用户可以使用 %%fsql
单元格魔法。该扩展还为 FugueSQL 单元格提供语法高亮。它适用于经典 notebook 和 Jupyter Lab。更多详情可以在安装说明中找到。
生态系统
作为一个抽象层,Fugue可以与许多其他开源项目无缝集成。
Python后端:
- Pandas
- Polars(仅限DataFrame)
- Spark
- Dask
- Ray
- Ibis
FugueSQL后端:
- Pandas - FugueSQL可以在Pandas上运行
- Duckdb - 进程内SQL OLAP数据库管理
- dask-sql - Dask的SQL接口
- SparkSQL
- BigQuery
- Trino
Fugue可作为后端使用或与以下项目集成:
- WhyLogs - 数据分析
- PyCaret - 低代码机器学习
- Nixtla - 时间序列建模
- Prefect - 工作流编排
- Pandera - 数据验证
- Datacompy(由Capital One提供) - 比较DataFrame
已注册的第三方扩展(主要用于Fugue SQL)包括:
- Pandas plot - 使用matplotlib或plotly可视化数据
- Seaborn - 使用seaborn可视化数据
- WhyLogs - 可视化数据分析
- Vizzu - 使用ipyvizzu可视化数据
社区和贡献
欢迎在Slack上与我们联系。我们还提供了贡献指南。
案例研究
- LyftLearn如何通过Kubernetes Spark和Fugue实现分布式计算的民主化
- Clobotics - 通过Fugue使用Spark进行大规模图像处理
- 使用Delta Lake、Fugue和Spark构建数据湖REST API的架构(由bitsofinfo撰写的文章)
提及的用途
- 在Interos, Inc.将数据科学投入生产(Anthony Holten的LinkedIn帖子)
- 在贝恩公司使用Fugue和Nixtla进行多时间序列预测(Fahad Akbar的LinkedIn帖子)
更多资源
查看我们最新的会议演讲和内容。要获取更完整的列表,请查看教程中的"内容"页面。
博客
- 为什么类Pandas接口不适合分布式计算
- 介绍FugueSQL — 适用于Pandas、Spark和Dask DataFrame的SQL(Khuyen Tran在Towards Data Science上的文章)
会议
- Lyft的分布式机器学习
- 比较扩展Python和Pandas代码的不同方法
- 使用Spark和Dask进行大规模数据验证(PyCon US)
- FugueSQL - 针对Pandas、Spark和Dask DataFrame的增强SQL接口(PyData Global)
- 分布式混合参数调优