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umap

先进的流形学习和数据降维算法

UMAP是一种高效的非线性降维和数据可视化算法。它能处理大规模高维数据,支持多种距离度量,可用于监督和半监督学习。UMAP在保持数据全局结构方面表现优异,运行速度快,理论基础扎实。该项目还包含densMAP功能,可在降维同时保留局部密度信息。作为t-SNE的有力替代,UMAP适用于多种机器学习场景。

umap-js - JavaScript实现的UMAP算法用于降维和数据可视化
GithubJavaScript实现UMAP-JS开源项目数据可视化机器学习降维技术
umap-js是UMAP算法的JavaScript实现,为数据降维和可视化提供高效解决方案。该库支持同步、异步和逐步拟合,以及监督投影和数据转换。通过npm安装,umap-js提供灵活的参数配置,适用于浏览器和Node.js环境下的数据分析与可视化项目。它是t-SNE的替代方案,可用于非线性降维。umap-js使用随机嵌入而非谱嵌入作为优化起点,适用于较小数据集。它不包含角度距离和稀疏数据表示的特殊功能,但保留了UMAP的核心算法特性。
umato - 创新型双阶段优化降维技术
GithubUMATO开源项目数据分析数据可视化机器学习维度降低
UMATO是一种新型降维技术,采用两阶段优化方法保留高维数据的全局和局部结构。与PCA、t-SNE等传统算法相比,UMATO在准确性、稳定性和可扩展性方面表现更佳。该技术特别擅长保持数据的全局结构,同时保持局部特征的竞争力。在处理大型数据集时,UMATO效率显著提高,平均比UMAP快14.3倍。UMATO通过pip安装简单便捷,适用于各种需要高质量数据可视化和分析的场景。
PaCMAP - 高效保留数据局部和全局结构的降维可视化工具
GithubPaCMAP全局结构可视化局部结构开源项目降维
PaCMAP是一种创新的降维算法,专注于高维数据的可视化。通过优化邻居对、中距离对和远距离对三种点对关系,PaCMAP能同时保留数据的局部和全局结构,突破了传统方法仅关注单一结构的局限。该算法已在机器学习权威期刊JMLR发表,并提供Python和R语言接口,适用于多领域的高维数据可视化分析。PaCMAP在MNIST等多个数据集上展现出优秀的性能,为数据科学家提供了强大的可视化工具。
wizmap - 交互式大规模机器学习嵌入可视化工具
GithubWizMap交互式探索多分辨率大规模数据嵌入可视化开源项目
WizMap是一款用于探索大规模机器学习嵌入的交互式可视化工具。它采用多分辨率嵌入摘要方法和地图式交互设计,便于导航和理解复杂嵌入空间。支持百万级嵌入点可视化,具备快速搜索和多模态数据处理能力。WizMap还提供嵌入演化动画展示,兼容多种计算笔记本,并支持URL共享功能。这一工具为研究人员和开发者提供了分析嵌入的有效方案。
ivis - 基于神经网络的高维数据降维和可视化算法
Githubivis算法开源项目数据可视化机器学习神经网络降维
ivis是一种基于暹罗神经网络的数据降维算法,专门用于处理高维数据集。该算法支持无监督和有监督学习,能够有效保持数据的局部和全局结构。ivis适用于大规模数据集,支持多种数据格式,包括numpy数组、稀疏矩阵和hdf5文件。它在聚类、异常检测等任务中表现出色,为数据分析提供了强大的可视化工具。ivis算法采用基于三元组的神经网络结构,能够高效处理百万级数据点和上千维特征,在保持数据结构方面常常优于t-SNE等传统方法。支持新数据点的转换,可以轻松集成到sklearn管道中,在高维数据可视化、聚类分析和异常检测等领域具有广泛应用前景。
ComplexHeatmap - R语言复杂热图包 实现多维数据可视化与灵活注释
ComplexHeatmapGithubR语言包开源项目数据分析热图可视化生物信息学
ComplexHeatmap是一个用于创建复杂热图的R软件包,提供灵活的多热图排列和多样化注释功能。该工具可视化不同数据集间的关联并揭示潜在模式,支持单热图、带注释热图、热图列表和行注释等功能。ComplexHeatmap适用于展示基因组数据、甲基化谱和单细胞RNA测序等复杂数据,并能创建增强型OncoPrint、UpSet图和3D热图。其高度定制性使其成为生物信息学和数据科学领域的强大可视化工具。
datamapplot - Python库实现数据地图的高质量可视化
DataMapPlotGithubPython库交互式绘图开源项目数据可视化数据地图
DataMapPlot是一个用于创建数据地图可视化的Python库。它可生成适用于演示、海报和论文的静态或简单交互式数据地图图表。用户只需标记数据点簇,库即可自动处理剩余工作。DataMapPlot提供多种自定义选项,包括暗色模式、字体和颜色映射等。其核心功能集中在create_plot和create_interactive_plot两个函数上,使用简便。该工具适合各类数据可视化需求,尤其适用于科研成果展示。
leafmap - Jupyter环境下的地理空间分析与交互式制图工具
GithubJupyterPython包leafmap交互式地图地理空间分析开源项目
leafmap是一个Python包,为Jupyter环境中的地理空间分析和交互式制图提供支持。它具有简单的API,支持多种地图后端,能够显示矢量和栅格数据,创建自定义图例和分屏地图。通过集成WhiteboxTools,leafmap提供了500多种地理空间分析工具。该工具适用于不同经验水平的用户,包括初学者和专业地理空间数据分析人员。
hdbscan - 灵活高效的层次密度聚类算法
GithubHDBSCAN密度聚类开源项目数据分析机器学习聚类算法
HDBSCAN是一种高性能的层次密度聚类算法,能够处理不同密度的聚类并对参数选择更加稳健。该算法主要参数直观易选,无需复杂调优,适合探索性数据分析。HDBSCAN具有快速可靠的特点,能返回有意义的聚类结果。此外,它还支持异常检测和分支检测,并提供可视化工具辅助理解聚类结果。该开源项目在GitHub上提供详细文档和示例,支持Python 2和3版本。
plantuml - 文本驱动的多功能UML和非UML图表生成工具
GithubPlantUMLUML图表可视化工具开源项目文本描述软件开发
PlantUML是一个开源的图表生成工具,通过文本描述创建UML和非UML图表。支持序列图、类图、用例图等UML图表,以及JSON数据、思维导图等非UML图表。该工具易于使用和集成,适用于开发人员、架构师和项目经理。PlantUML拥有活跃的社区,提供多种许可选项,可满足不同应用场景的需求。
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