Project Icon

snakepipes

基于Snakemake的多功能NGS数据分析工作流程

snakePipes提供多种NGS数据分析工作流程,包括DNA测序、ChIP-seq、RNA-seq等,支持等位基因特异性分析,并能轻松扩展到大规模数据集。这个基于Snakemake构建的框架旨在简化分析流程,提供灵活配置选项。通过Conda环境管理,snakePipes简化了安装过程,并为用户提供详细文档指导使用。该开源项目持续更新,旨在为生物信息学研究提供可靠、高效的分析工具,欢迎社区参与改进。

awesome-apache-airflow - Apache Airflow资源大全 工作流管理平台指南
Apache AirflowGithub工作流管理开源软件开源项目数据管道调度系统
本项目汇集了Apache Airflow的综合资源,包括部署方案、教程、最佳实践和工具库等。内容涵盖重要链接、视频教程和商业服务,为Airflow用户提供全面指南。项目持续更新,致力于成为Airflow社区的权威参考。
datajoint-python - 基于关系原则的科学工作流管理框架 DataJoint
DataJointGithubPython框架关系数据模型开源项目数据管理科学工作流管理
DataJoint for Python作为开源科学工作流管理框架,基于关系数据模型设计。框架提供一致的数据组织、计算和查询方法,适用于处理大规模实验数据。项目始于2009年,现已被多个实验室采用。DataJoint支持简便安装,提供完善的文档和教程资源,并包含针对神经科学的示例管道。该框架致力于优化数据处理流程,提高科研工作效率。
scispacy - 科学文献处理的定制spaCy管道与模型
GithubPython 3.6scispaCyspaCy安装安装方式开源项目
scispaCy项目提供了适用于科学文献处理的定制化spaCy管道和模型,包括基于生物医学数据训练的分词器、词性标注器和实体识别模型。用户可轻松安装和使用这些工具,项目支持多种NER模型和实体链接器,适合不同任务使用,并提供详细的安装和使用指南。
flyte - 开源数据和机器学习流程编排工具
FlyteGithub云服务开源项目数据流水线机器学习编程语言
Flyte是一个开源的数据与机器学习工作流编排器,支持在Kubernetes平台上扩展和重复使用。它使用户能够使用Python SDK开发并在多种环境下部署,简化了分布式计算和资源管理。
awesome-single-cell - 综合单细胞数据分析工具和方法清单
Github单细胞RNA测序基因表达分析开源项目生物信息学细胞群体分析软件包
该资源列表汇集了单细胞数据分析的软件包和方法,包括RNA-seq、ATAC-seq等数据类型。涵盖质量控制、基因网络识别、细胞聚类、降维和轨迹推断等分析步骤。同时提供教程、工作流程、网络门户和相关文献链接。列表持续更新,为单细胞研究提供全面参考。
alphaflow - 蛋白质构象集生成的流匹配模型
AlphaFlowAlphaFoldGithub分子动力学开源项目生成建模蛋白质构象集
AlphaFlow是基于AlphaFold的改进版本,通过流匹配目标微调,专门生成蛋白质构象集合。它模拟实验和分子动力学集合,提供完整代码、说明和模型权重。项目还包括ESMFold的微调版本ESMFlow。这些工具有助于研究蛋白质结构多样性和动态特性,为蛋白质科学研究提供新的方法和视角。
chrombpnet - 深度学习模型分析染色质可及性和调控序列
ChromBPNetGithub开源项目染色质可及性深度学习转录因子顺式调控
ChromBPNet是一个用于分析染色质可及性数据的深度学习模型。它采用偏差因子化和全卷积神经网络,能在碱基分辨率上揭示调控序列特征、转录因子结合位点和调控变异。通过自动校正实验偏差,该模型可准确捕捉染色质轮廓的多尺度特征,为研究基因调控提供了新的计算工具。
quackpipe - 无服务器OLAP API实现DuckDB与ClickHouse HTTP接口兼容
APIClickHouseDuckDBGithubOLAP云存储开源项目
QuackPipe是基于DuckDB构建的无服务器OLAP API,模拟并兼容ClickHouse的HTTP API。用户可通过熟悉的接口使用DuckDB SQL和云存储,保持现有习惯和集成。该项目支持云存储操作、文件模式、STDIN快速查询和ClickHouse可执行UDF等功能。QuackPipe还提供简洁的在线playground,方便用户尝试示例查询。
screen-pipe - 全天候屏幕和音频捕捉,支持个性化AI开发
AGI HouseGithubOllamaRewind.aiRustScreenpipe开源项目
Screenpipe提供全天候屏幕和音频捕捉,支持Ollama,开放且安全,用户完全掌控数据。该项目采用Rust开发,兼容MacOS、Windows和Linux,提供CLI和桌面应用。支持多种语音识别和OCR引擎,为开发者提供强大的工具和API接口。适用于搜索、自动化、分析和个人助手等应用场景,旨在简化开发者工作流程,提高效率。
pachyderm - 自动化数据处理与版本控制平台
GithubKubernetesPachyderm开源项目数据版本控制数据管道数据血统
Pachyderm是一个开源的数据工程平台,提供自动化的数据处理流水线和版本控制功能。该平台支持复杂的数据转换,并具备数据血缘跟踪能力。基于Kubernetes构建,Pachyderm实现了自动扩展和并行处理,可部署在主流云平台和本地环境。它为数据工程团队提供了一个高效的CI/CD引擎,适用于各类数据处理场景。
项目侧边栏1项目侧边栏2
推荐项目
Project Cover

豆包MarsCode

豆包 MarsCode 是一款革命性的编程助手,通过AI技术提供代码补全、单测生成、代码解释和智能问答等功能,支持100+编程语言,与主流编辑器无缝集成,显著提升开发效率和代码质量。

Project Cover

AI写歌

Suno AI是一个革命性的AI音乐创作平台,能在短短30秒内帮助用户创作出一首完整的歌曲。无论是寻找创作灵感还是需要快速制作音乐,Suno AI都是音乐爱好者和专业人士的理想选择。

Project Cover

有言AI

有言平台提供一站式AIGC视频创作解决方案,通过智能技术简化视频制作流程。无论是企业宣传还是个人分享,有言都能帮助用户快速、轻松地制作出专业级别的视频内容。

Project Cover

Kimi

Kimi AI助手提供多语言对话支持,能够阅读和理解用户上传的文件内容,解析网页信息,并结合搜索结果为用户提供详尽的答案。无论是日常咨询还是专业问题,Kimi都能以友好、专业的方式提供帮助。

Project Cover

阿里绘蛙

绘蛙是阿里巴巴集团推出的革命性AI电商营销平台。利用尖端人工智能技术,为商家提供一键生成商品图和营销文案的服务,显著提升内容创作效率和营销效果。适用于淘宝、天猫等电商平台,让商品第一时间被种草。

Project Cover

吐司

探索Tensor.Art平台的独特AI模型,免费访问各种图像生成与AI训练工具,从Stable Diffusion等基础模型开始,轻松实现创新图像生成。体验前沿的AI技术,推动个人和企业的创新发展。

Project Cover

SubCat字幕猫

SubCat字幕猫APP是一款创新的视频播放器,它将改变您观看视频的方式!SubCat结合了先进的人工智能技术,为您提供即时视频字幕翻译,无论是本地视频还是网络流媒体,让您轻松享受各种语言的内容。

Project Cover

美间AI

美间AI创意设计平台,利用前沿AI技术,为设计师和营销人员提供一站式设计解决方案。从智能海报到3D效果图,再到文案生成,美间让创意设计更简单、更高效。

Project Cover

AIWritePaper论文写作

AIWritePaper论文写作是一站式AI论文写作辅助工具,简化了选题、文献检索至论文撰写的整个过程。通过简单设定,平台可快速生成高质量论文大纲和全文,配合图表、参考文献等一应俱全,同时提供开题报告和答辩PPT等增值服务,保障数据安全,有效提升写作效率和论文质量。

投诉举报邮箱: service@vectorlightyear.com
@2024 懂AI·鲁ICP备2024100362号-6·鲁公网安备37021002001498号