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molfeat

多功能分子特征提取框架

molfeat是一个开源的分子特征提取框架,集成多种预置分子特征提取器。它提供简洁高效的API,统一预训练分子嵌入和传统特征提取方法。框架支持通过插件扩展自定义特征提取器,并采用缓存机制优化性能。作为分子特征化的综合解决方案,molfeat适用于广泛的分子建模和分析应用场景。

lightdock - 基于萤火虫群优化算法的多功能蛋白质对接框架
GSO算法GithubLightDock分子模拟开源项目生物信息学蛋白质对接
LightDock是一款基于萤火虫群优化算法的蛋白质对接框架,支持蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽段和蛋白质-DNA的对接。该框架具有高度灵活性,允许用户自定义评分函数,支持局部无梯度最小化,并能限制模拟以聚焦特定相互作用区域。LightDock还支持受体和配体的残基限制,为分子对接研究提供了多功能且强大的工具。
Mephisto - 开源众包任务管理框架
GithubMephisto人机交互众包平台开源开源项目
Mephisto是一个开源众包任务管理框架,旨在简化启动、监控和审查众包项目的流程。它能够隐藏人类交互或输入项目的复杂细节,并支持将任务轻松集成到其他项目中。Mephisto提供快速上手指南、多样化的项目支持和完善的文档,适用于众包研究和应用开发。该框架有助于提高众包任务的效率和可重复性,为研究人员和开发者提供了一个灵活的工具。
MMSA - 多模态情感分析统一框架助力研究
GithubMMSAPython工具包多模态情感分析开源项目数据集深度学习模型
MMSA是一个多模态情感分析统一框架,集成15种先进MSA模型,支持MOSI、MOSEI和CH-SIMS数据集。框架提供Python API和命令行工具,方便使用。结合MMSA-FET工具包,可进行自定义多模态特征提取实验。MMSA为多模态情感分析研究提供了全面系统的支持平台,助力相关领域的深入研究与创新。
foldseek - 高效精准的大规模蛋白质结构比对工具
FoldseekGithub开源项目结构搜索结构聚类蛋白质复合物蛋白质结构比对
Foldseek是一款用于大规模蛋白质结构集比对的开源工具。它能快速、敏感地比较海量蛋白质结构,支持对AlphaFoldDB和PDB等数据库进行搜索。Foldseek提供命令行界面和网页服务器,可进行结构搜索、聚类和多聚体比对。采用创新的3Di+AA结构对齐算法,在保证准确性的同时显著提升速度。Foldseek为结构生物学研究提供高效可靠的计算支持,助力蛋白质结构分析。
marvin - 多功能AI工具包,提供文本、图像与音频处理功能
AI工具包GithubMarvin分类实体提取开源项目数据生成
Marvin是一个轻量级AI工具包,提供可靠、可扩展的自然语言接口解决方案。它涵盖文本、图像和音频的生成、分类、实体抽取等多种功能,支持独立或组合使用,适用于各种开发场景。Marvin无需复杂的代码,即可将AI功能集成到现有软件项目中,实现快速部署。该项目开源且免费使用,由Prefect团队开发和维护。
open-metric-learning - 开源的PyTorch度量学习框架 支持多模态嵌入训练
GithubPyTorchopen-metric-learning嵌入向量度量学习开源项目检索系统
open-metric-learning是一个基于PyTorch的开源度量学习框架,用于训练和验证高质量嵌入模型。它提供端到端流水线、实用案例和预训练模型库,支持图像和文本等多种模态。该框架具有统一的检索结果处理和评估方法,适用于人脸识别、商品搜索等嵌入学习任务。已被多家知名公司和机构采用,是一个功能丰富、易于上手的度量学习工具。
mosec - 云端机器学习模型服务框架
GithubMOSEC云计算动态批处理开源项目模型服务高性能
Mosec是一个高效且灵活的模型服务框架,旨在简化云端机器学习模型的部署和服务构建。其采用Rust和Python,实现高速性能与易用性,支持动态批处理和流水线处理,适用于CPU和GPU的混合工作负载。Mosec还提供模型预热、优雅关闭和Prometheus监控,便于通过Kubernetes等系统进行管理。
RNA-FM - 高精度RNA结构和功能预测的解释性基础模型
GithubRNA-FMRNA功能预测RNA结构预测RNA语言模型开源项目预训练模型
RNA-FM是一个基于未注释数据训练的RNA基础模型,在RNA结构预测和功能相关任务中表现出色。项目提供预训练模型和代码,支持RNA嵌入生成和二级结构预测。最新更新包含RNA家族聚类和类型分类教程,以及针对mRNA编码序列的mRNA-FM模型。RNA-FM为RNA研究提供了有力工具,有助于提高RNA结构和功能预测的准确性。
mola - 模块化本地化和映射框架,兼容多种ROS 2版本
GithubMOLAROS 2建图开源包开源项目本地化
框架MOLA专注于本地化和映射,包含基础开源包和多个扩展包,兼容ROS 2 Humble、Iron、Jazzy和Rolling版本。提供了详细的文档和示例,包含构建指南、演示和API参考。项目的构建和测试在多个ROS 2版本上表现优异,确保其跨版本兼容性和稳定性。用户可通过官方文档获取更多信息。
video_features - 多模态视频特征提取框架 支持多种深度学习模型
GitHub项目Github多模态分析开源项目深度学习模型视频特征提取计算机视觉
video_features是一个开源的视频特征提取框架,支持视觉、音频和光流等多种模态。该框架集成了S3D、R(2+1)d、I3D-Net等动作识别模型,VGGish声音识别模型,以及RAFT光流提取模型。它支持多GPU和多节点并行处理,可通过命令行或Colab快速使用。输出格式灵活,适用于视频分析相关的研究和应用。
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